論文では，参考文献をかかなければなりません．参考文献は，本文中の適切な場所で引用しなければなりません．引用しない場合，学位が剥奪された人がいましたね．

で，文献を入力する方法には，面倒臭く間違いが入りやすい「手動入力」と，間違えないで簡単な「自動入力」の2通りがあります．

日本語を含む場合, 自動入力はサポートされていません（文献リストを選ぶ窓が空っぽになるバグがある）.

2019年に予定のLyX2.3では可能になる可能性が数％あります．←ちょっと微妙ですが一応可能になった

•  一つ一つ，手動で入力
• 雑誌の提供するデータを使って自動入力
  • で, データ(bibファイル)を混ぜる方法
•  文献スタイル
• 日本語文献スタイル

手動入力

1. がんばって
2. 乳力！ いや，いまどき, キーボードで入力なんてバカな事する奴が存在するとは思えないけど，ミスタイプしたいなら，頑張って乳力しえください．大変だね〜
   1. それではわからない場合，次のように行います．
   2. 【文章】【設定】【LaTeXプリアンブル】に \usepackage{cite} を追加しておいた方が，後々幸せになれる
   3. 文章の終わりに，書誌情報を作成    
      
   4. で，文献データを入れて，グレーの部分をクリックして「キー」をつけときます．
   5. で，山盛り文献データを入力したら，本文でも引用できます．引用したいところで【挿入】【文献引用】
   6. さっき入力した文献データが左に出るので，引用したいやつを右の表に入れる
   7. この方法では，文章最後の文献データを入力した順に番号がつきます．引用した順にはなりません．あなたが，手動で，番号が綺麗に並ぶように，文献データを並び替える必要があります．
   8. 番号の並び替えであるとか，文献データの書き方が，あーいやだ，という向きは，頑張って下記の「自動入力」しましょうね．

自動入力

似たようなものを入力する場合，データベースを利用した方が良いです．他人が使っているものがネットにあったりもするかもね. お友達とEndNote共有とかもありだろうが, ここでは原始的なBIBTEXを紹介します．

1. 【文書】【設定】【書誌情報】で【処理娘】をbibtexちゃんにします．
2. 文書の終わりに，【挿入】【一覧・目次等】【bibtex書誌情報】
3. どこからか，bibファイルを持ってきます．
   1. たとえばAIPだったら，下記のように    
           
      
   2. 別の方法として，GoogleScalarにBIBTeXを言わせるという手ももあるみたいですね．

   3. AIPがゲロるbibtexの文献情報は, 論文タイトルなどに含まれる「ハイフン」- が，ユニコード文字になっているのでTeXが理解しないので注意. なんかーがあったら，消して半角マイナス「-」に直して保存な

      Elsevierも面白いことしてるぞ？Tadashi という日本人名は, Ta-i に変換されてジャーナルに保存されいる．Taダッシュi って，まるでクイズだが．このダッシュのおかげで，TeXがバグるので注意

4. bibファイルをクリックすると，知らないソフトが起動しますので，それを使って文献データベースを作ります．たくさん文献を追加すると，下の図のようになっていくはずです．    
   
5. わざわざ人間がデータベースを入力するのは面倒です．別の文献を追加するには，ダウンロードした別のBIBファイルを，ウィンドウの左のほうのどこかにポイっと投げると，そこに入ります．
   1. 上のsample.bib の図では, KEYWORDが全部EMPTYなので，分類されていません．これでは困りますね．
   2. そこで，各個の文献をクリックして，KEYWORDをつけて差し上げるの    
      
   3. 
      各文献に[KEYWORD]をつけて分類すると，下の図のようになります    
      
   4. この場合，あたらしい BIBファイルを，左欄のKEYWORDの該当する部分にぽいっと放り投げると，そこに入ります．    
      
   5. 放り投げた奴は, Last Importに出てくるので，適宜修正してデータベースを保存します．
6. データベースができたので，LyXでデータベースを挿入します．さっきの操作で【BibTeXが作成した書誌情報】が文書に入っているはずですので，くりこ
7. こんなのが出るので，【追加】【一覧】で，おまえのファイルを追加します．    
   
8. 文献の表示の仕方は，【引用スタイル】で調整します．
   1. 学会によっては，引用スタイルはこれです，という bst ファイルが提供されていたりします．
   2. それが，さいしょっから【引用スタイル】にあればラッキーです．
   3. アンラッキーな場合，/usr/local/texlive/texmf-local/bibtex/bst/学会名/そのファイル.bst にコピー
   4. sudo mktexlsr
   5. さっきの画面の【再捜査】
9. これで準備完了です．
10. 文献を引用するには，二通りの方法があります．
    1. LyXで，【挿入】【文献引用】    
       
    2. データベースソフトで【Action】【Send Selections 2 LyX】    
       

BIBファイルをマージ

自動入力を使っていくと，「A先輩のBIBファイル」「B先輩のBIBファイル」を両方使いたい，なんてことが出てきます．先ほどから登場している，名称不明のデータベースソフトで，文献データベースを混ぜてしまいましょう．

まず，混ぜ合わせた結果となるBIBファイルを開いておきます：

そこで, 【Publication】【New Publication from File】を選んで，混ぜたいBIBファイルを指定します．

混ぜると, 重複データができますよね．これは

このように検出されます．検出うっかり外しちゃったら【Database】【Select Duplicates】で再度検出できます．

ダブってるのは【Delete】ボタンで消去してしまいましょう．

日本語の文献を自動入力する方法

どういうわけか，日本語文献bibを分けておかなければなりません：

この例では，英文論文がreference.bibに，和文論文が reference-jp.bib に入っています．文献の選択などでは，どちらのbibファイルに入っているか，などは区別されません．どうなっているんでしょうね？

文献スタイルって重要じゃねえか？

文献スタイルを設定しないと，文献の番号がソートされず（つまり文献番号がデタラメ），とても変です．ここで設定します：

良いものを選びましょう．

ELSEVIERスタイル

elsarticle-numです．まあとりあえず万能じゃねえか？

SIAM-Journalスタイル

少々古めかしくないか？

AIAAスタイル

まあこれもありな

日本語文献スタイル

電気通信学会IEEE有志が，使える日本語スタイルを開発しています．もちろん日本電気通信学会用のものですが，よくできているので使ってもバレないでしょう．

サンプルは：

まあこんな感じのものです．で，これを使うには

まんず，jIEEEtran をダウンロード

これは, あなたのMacのTeXLiveユーティリティーを使って，なんとか導入してください．

あなたのMacのTeXを改造

LyX2.3にはバグがあり，jIEEEtranを使うには，手動でビルドする必要があります．それは面倒ですので，改造してjIEEEtranを使えるようにしましょう.

改造内容：LyX2.3では，新しい汎用言語の文献処理プログラム upbibtex を指定できません．指定できるメニューもあるはずなのですが，「動作しません」と文句を言ってしまい，前にすすみません．そこで, もう使わなくなった古い英語用文献処理プログラム bibtex と交換してしまい，LyXでは，bibtex を指定することにします．新型は，ある程度，旧型の真似をできるので，バレないはず．

ターミナルで, 

% cd /Library/TeX/texbin 
% sudo mv bibtex bibtex~ 
Password: あなたのMacのパスワード 
% sudo cp upbibtex bibtex

そこで, LyXではbibtexを指定してあげます：

改造したくないから手動でビルド

もちろん，【ファイル】【書き出し】【LaTeX(LuaTeX)】して myFuckingFile.tex ファイルを出力し

% lualatex myFuckingFile
% upbibtex myFuckingFile
% lulakatex myFuckingFile
% lulakatex myFuckingFile

ほとんどの場合，これで lulakatex myFuckingFile.pdf を作成できるでしょう．

 んでは，あなたの文書の文献スタイルを指定

文献スタイル，どうしてもなんとかしたい

という欲望はみんなが持つもののようですね．ここに従って改造してみよう.

plainnatスタイルをもとに変更してみましょう. まずは

$ kpsewhich plainnat.bst
/usr/local/texlive/2019/texmf-dist/bibtex/bst/natbib/plainnat.bst

にゃるほど. こげなところにありよるのか.

sudo mkdir /usr/local/texlive/texmf-local/bibtex/bst/local/japanese
cp `kpsewhich plain.bst` /usr/local/texlive/texmf-local/bibtex/bst/local/japanese/jplain.bst
sudo mktexlsr

まずはコピーした.

なんかもうめんどうなんですけど.

章別に参考文献

各章に参考文献を作ることが可能です．【Help】【高度な機能編】3.1.3 では, まあいろいろある，と説明されていますが, 動作が確認できるのは chapterbibib を使う方法です．

1. 子文書別に参考文献を入れることができます．によって, 子文書タイプにしておきます
2. 【文書】【設定】【書誌情報】で以下を設定します:    
   
3. 各章の末尾に【挿入】【一覧】【BibTeX書誌情報】

これで, 各章の末尾に書誌情報が出力されるようになります.

場合によっては, 参考文献が新ページに入ってしまって困るかもしれません．章別の参考文献であるのに, それはちょいと大げさである．それは・・・もうthebibliographyを改造するしかありませんね．

あんたの文書クラスを探します. たとえばltjsbookであれば

$ kpsewhich ltjsbook.cls    
/usr/local/texlive/2019/texmf-dist/tex/luatex/luatexja/ltjsbook.cls

こいつから, thebibliographyの定義を探し出します:

1394 \newenvironment{thebibliography}[1]{%
1395   \global\@jsc@warnoldfontcmdexceptiontrue
1396   \global\let\presectionname\relax
1397   \global\let\postsectionname\relax
1398   \chapter*{\bibname}\@mkboth{\bibname}{}%
1399   \addcontentsline{toc}{chapter}{\bibname}%
1400   \list{\@biblabel{\@arabic\c@enumiv}}%
1401         {\settowidth\labelwidth{\@biblabel{#1}}%
1402         \leftmargin\labelwidth
1403         \advance\leftmargin\labelsep
1404         \@openbib@code
1405         \usecounter{enumiv}%
1406         \let\p@enumiv\@empty
1407         \renewcommand\theenumiv{\@arabic\c@enumiv}}%
1408   \sloppy
1409   \clubpenalty4000
1410   \@clubpenalty\clubpenalty
1411   \widowpenalty4000%
1412   \sfcode`\.\@m}
1413  {\def\@noitemerr
1414   {\@latex@warning{Empty `thebibliography' environment}}%
1415   \endlist
1416   \global\@jsc@warnoldfontcmdexceptionfalse%
1417}

おう, いたいた. こいつだ. 赤のとこでchapterで文献が構成されている．chapterに文献つけたら別のchapterができるので悔ページ，っておかしいだろうが．そこでこいつらをぷりアンブルにコピー．\newenvironment はもちろん \renewenvironmentで. んま, chapter じゃ変だから, section にしたら良い．

ハイパーリンクの付け方

[文章]→[設定]→[PDF特性]で「Hyperrefサポートを使う」にチェック．    
また，[一般]→[自動的にヘッダを補完]と[ハイパーリンク]→[リンクの周りに枠をつけない]にもチェック．