Linuxクラスタで計算を行う方法を解説します.
- クラスタ用のアカウント(ユーザー名, パスワード)をもらいます.
- SSHソフトを用いてログインします.
- プログラムを作成するか, プログラムファイルを転送します.
- 並列化を行う場合, MPIあるいはOpenMP, 自動並列化を使用します.
- FortranあるいはCコンパイラを用いて, プログラムをコンパイルします.
- 数時間の長大計算は,ジョブ管理システムを用い, クラスターの計算ノードで実行します.
以下では, その各項目について説明します.